针对“贯彻习近平总书记重要批示不严肃”的问题，西安市委修订贯彻落实习近平总书记重要指示批示相关文件，在全市范围持续开展落实情况“回头看”，对贯彻落实中存在的问题进行自查自纠。深刻汲取秦岭北麓违建别墅问题教训，加大直查直办、督查督办力度，2019年西安共查处秦岭生态环境领域违纪违规案件56起、问责68人，其中厅局级12人、处级7人。针对“没有把习近平总书记关于秦岭保护重要指示批示精神贯彻落实到日常监管、执法等工作中”的问题，陕西省生态环境厅党组制订以秦岭生态环境保护为重点的青山保卫战行动方案及年度工作方案、任务清单，经省政府印发实施；印发通知，组织西安等6市及部分县（区）深入开展秦岭生态环境突出问题专项整治工作。此外，还牵头组织开展秦岭生态环境保护联合执法工作，加强秦岭生态环境保护长效监管执法机制建设。
针对“纪委监委落实监督责任不够有力”的问题，宝鸡市纪委监委健全完善系统内部工作机制，对涉及秦岭保护相关问题线索建立专门台账，并建立与市秦岭生态环境专项整治工作领导小组和相关职能部门之间问题线索双向移送和管理分办机制，加强沟通协调，畅通问题线索收集渠道。同时，成立6个调研督导组，由市纪委监委领导带队，对整改落实情况进行督导检查。该市还对近三年查办的涉秦岭生态环境保护问题线索和案件进行“大起底”，开展“回头看”；对涉及秦岭生态环境保护问题线索优先分办，限期办结。2019年宝鸡纪检监察机关共处置涉秦岭生态环境保护问题线索52件，党纪政务处分56人。
围绕巡视反馈问题整改落实，被巡视地区和单位党组织强化督查考核、追责问责，确保取得实效。安康市委坚持整改验收销号机制，安排成立五个察访督导组，按照“四不两直”要求，对各县区和市直有关部门整改落实情况实行专案盯办、全程跟踪、销号管理；制定问题整改督查督办实施办法，督查督办结果纳入市级党政机关和县区年度目标责任考核，同时移交市委组织部作为评价、考核、选拔、任用领导干部的重要依据。商洛市以视察调研、专项督查、明察暗访相结合，开展常态化督促检查，发现问题、现场交办、限期整改，并对秦岭地区违建问题和生态环保顽疾，实行专项督办、挂号督办。对整改不到位等问题，严肃追责，推动整治。2019年8月至2020年2月底，该市共查处生态环保领域案件110件132人，党纪政务处分101件116人，通报曝光生态环保领域典型案例8期34件139人。
2019年5月30日至7月5日，陕西省委10个巡视组分别对陕西省发改委等4个省级部门单位和西安市等6个设区市开展了秦岭生态环境保护专项巡视。2019年8月7日至12日进行了反馈。